工作室最初由安迪·盖文（Andy Gavin）和杰森·鲁宾（Jason Rubin）在1984年以独立开发者的身份成立，之后在2001年由索尼电子娱乐买下。盖文和鲁宾开发过多款成功的游戏作品，包括Mega Drive平台上的《力量之环》（直译，Rings of Power）和3DO主机上的《战士之道》（直译，Way of the Warrior）。在这些早期作品之后，环球互动工作室（Universal Interactive Studios）与两人签下了委托制作三部小成本作品的合约，其提供的资金也帮助了Naughty Dog的扩张。

曾为世嘉制作过《索尼克2》的马克·瑟尼（Mark Cerny）说服了Naughty Dog将新的资源用在专注开发以角色为中心的平台游戏，并针对新世代游戏机的3D运算能力作更有效地运用。这项建议最终让工作室在1996年8月31日于PlayStation上推出了《古惑狼》（Crash Bandicoot）。在接下来的数年间，Naughty Dog总共推出了三款《古惑狼》的续作。在2001年1月，索尼宣布将会收购顽皮狗。接下来在推出《古惑狼赛车》（Crash Team Racing）之后，工作室开始进行PlayStation 2《捷克与达斯特》（Jak and Daxter）的开发。

2004年，顽皮狗的主席与创办人之一的杰森·鲁宾离开了工作室，并开始着手制作名为《铁人与少女》（Iron and the Maiden）的漫画作品。Naughty Dog除了作为索尼全球工作室（Sony World Wide Studios）旗下的一员之外，同时也在其中以ICE Team之名担任核心的技术团队。Naughty Dog在PlayStation 3上的的第一部作品是在2007年推出的《神秘海域：德雷克船长的宝藏》，接着分别于2009年和2011年推出《神秘海域2：纵横四海》和《神秘海域3：德雷克的诡计》两款续作。Naughty Dog也曾以“同时间只开发一款游戏”和“在一款平台上只推出一套系列作”的原则在玩家间受到批评。这两个原则直到Naughty Dog在2011年12月10日发表PlayStation 3新作《最后生还者》才被打破。《最后生还者》是由工作室内的第二团队负责开发。

在2011年11月21日，索尼的官方PlayStation博客上宣布了《捷克与达斯特》将会在PlayStation 3推出高清（HD）重制版本。在2012年2月7日推出的《捷克与达斯特》高清版本由Mass Media公司负责移植重制，除了游戏画质的提升之外，并加入了3D效果以及PlayStation 3上的奖杯系统。

2013年11月，原《光环》系列首席游戏引擎程序员余国荔宣布离开微软，加入顽皮狗。